MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 35176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013156	CCT	2	6	184947	184952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810164
4502	NC_013156	AAT	2	6	184976	184981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810164
4503	NC_013156	AAACT	2	10	184999	185008	60 %	20 %	0 %	20 %	256810164
4504	NC_013156	T	6	6	185018	185023	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
4505	NC_013156	TA	3	6	185087	185092	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
4506	NC_013156	TA	3	6	185136	185141	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
4507	NC_013156	CTT	2	6	185146	185151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
4508	NC_013156	TTAT	2	8	185175	185182	25 %	75 %	0 %	0 %	256810164
4509	NC_013156	ATT	2	6	185226	185231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810164
4510	NC_013156	TCC	2	6	185237	185242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810164
4511	NC_013156	TTC	2	6	185264	185269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
4512	NC_013156	CTG	2	6	185371	185376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810164
4513	NC_013156	TTC	2	6	185427	185432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
4514	NC_013156	AAAT	2	8	185445	185452	75 %	25 %	0 %	0 %	256810164
4515	NC_013156	AT	3	6	185467	185472	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
4516	NC_013156	ATC	2	6	185501	185506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810164
4517	NC_013156	CT	3	6	185517	185522	0 %	50 %	0 %	50 %	256810164
4518	NC_013156	TAG	2	6	185526	185531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810164
4519	NC_013156	CTG	2	6	185558	185563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810164
4520	NC_013156	CTT	2	6	185572	185577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
4521	NC_013156	TC	3	6	185604	185609	0 %	50 %	0 %	50 %	256810164
4522	NC_013156	TG	3	6	185640	185645	0 %	50 %	50 %	0 %	256810164
4523	NC_013156	T	7	7	185653	185659	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
4524	NC_013156	ATC	2	6	185732	185737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810164
4525	NC_013156	TC	3	6	185749	185754	0 %	50 %	0 %	50 %	256810164
4526	NC_013156	AAC	2	6	185781	185786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810164
4527	NC_013156	T	6	6	185794	185799	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
4528	NC_013156	CTG	2	6	185831	185836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810164
4529	NC_013156	TAA	2	6	185855	185860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810164
4530	NC_013156	TAAA	2	8	186124	186131	75 %	25 %	0 %	0 %	256810165
4531	NC_013156	ATT	2	6	186158	186163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810165
4532	NC_013156	AAG	2	6	186167	186172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810165
4533	NC_013156	TTG	2	6	186238	186243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810165
4534	NC_013156	GAT	2	6	186252	186257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810165
4535	NC_013156	GTT	2	6	186273	186278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810165
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4537	NC_013156	AG	3	6	186343	186348	50 %	0 %	50 %	0 %	256810165
4538	NC_013156	TAA	2	6	186358	186363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810165
4539	NC_013156	TGT	2	6	186431	186436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810165
4540	NC_013156	ATAAA	2	10	186484	186493	80 %	20 %	0 %	0 %	256810165
4541	NC_013156	CATT	2	8	186496	186503	25 %	50 %	0 %	25 %	256810165
4542	NC_013156	AAATG	2	10	186626	186635	60 %	20 %	20 %	0 %	256810166
4543	NC_013156	ATT	2	6	186675	186680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810166
4544	NC_013156	CAA	2	6	186692	186697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810166
4545	NC_013156	ATT	2	6	186698	186703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810166
4546	NC_013156	CTGT	2	8	186734	186741	0 %	50 %	25 %	25 %	256810166
4547	NC_013156	CT	3	6	186766	186771	0 %	50 %	0 %	50 %	256810166
4548	NC_013156	A	6	6	186778	186783	100 %	0 %	0 %	0 %	256810166
4549	NC_013156	TTG	3	9	186830	186838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810166
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4551	NC_013156	AGA	3	9	186966	186974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810166
4552	NC_013156	TTG	2	6	187004	187009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810166
4553	NC_013156	TTGA	2	8	187033	187040	25 %	50 %	25 %	0 %	256810166
4554	NC_013156	AG	3	6	187081	187086	50 %	0 %	50 %	0 %	256810166
4555	NC_013156	GTT	2	6	187124	187129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810166
4556	NC_013156	GAG	2	6	187133	187138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810166
4557	NC_013156	AT	3	6	187176	187181	50 %	50 %	0 %	0 %	256810166
4558	NC_013156	TCAA	2	8	187222	187229	50 %	25 %	0 %	25 %	256810166
4559	NC_013156	AATT	2	8	187256	187263	50 %	50 %	0 %	0 %	256810166
4560	NC_013156	ATT	2	6	187276	187281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810166
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4562	NC_013156	AG	3	6	187301	187306	50 %	0 %	50 %	0 %	256810166
4563	NC_013156	AAG	3	9	187471	187479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810166
4564	NC_013156	AGATGA	2	12	187503	187514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810166
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4570	NC_013156	AATT	2	8	187709	187716	50 %	50 %	0 %	0 %	256810166
4571	NC_013156	TTG	2	6	187754	187759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810166
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4576	NC_013156	AG	3	6	188001	188006	50 %	0 %	50 %	0 %	256810166
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4580	NC_013156	A	6	6	188230	188235	100 %	0 %	0 %	0 %	256810167
4581	NC_013156	GA	3	6	188264	188269	50 %	0 %	50 %	0 %	256810167
4582	NC_013156	AGA	2	6	188275	188280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810167
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4584	NC_013156	GTT	2	6	188372	188377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810167
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4589	NC_013156	GT	3	6	188797	188802	0 %	50 %	50 %	0 %	256810167
4590	NC_013156	ATT	2	6	188910	188915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810167
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4593	NC_013156	AAG	2	6	188999	189004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810167
4594	NC_013156	GAA	2	6	189077	189082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810167
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4597	NC_013156	A	6	6	189164	189169	100 %	0 %	0 %	0 %	256810167
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4603	NC_013156	AG	3	6	189472	189477	50 %	0 %	50 %	0 %	256810167
4604	NC_013156	GTTGG	2	10	189478	189487	0 %	40 %	60 %	0 %	256810167
4605	NC_013156	TAAA	2	8	189540	189547	75 %	25 %	0 %	0 %	256810167
4606	NC_013156	TG	3	6	189552	189557	0 %	50 %	50 %	0 %	256810167
4607	NC_013156	TAT	2	6	189591	189596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810167
4608	NC_013156	GTT	2	6	189641	189646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810167
4609	NC_013156	ATG	3	9	189669	189677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810167
4610	NC_013156	AAG	2	6	189681	189686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810167
4611	NC_013156	A	6	6	189783	189788	100 %	0 %	0 %	0 %	256810168
4612	NC_013156	ATA	2	6	189818	189823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810168
4613	NC_013156	TCA	2	6	189827	189832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810168
4614	NC_013156	AATC	2	8	189861	189868	50 %	25 %	0 %	25 %	256810168
4615	NC_013156	GTTATG	2	12	189905	189916	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256810168
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4617	NC_013156	T	6	6	189958	189963	0 %	100 %	0 %	0 %	256810168
4618	NC_013156	TCA	2	6	189974	189979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810168
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4620	NC_013156	T	6	6	190051	190056	0 %	100 %	0 %	0 %	256810168
4621	NC_013156	TTTA	2	8	190063	190070	25 %	75 %	0 %	0 %	256810168
4622	NC_013156	T	6	6	190097	190102	0 %	100 %	0 %	0 %	256810168
4623	NC_013156	T	7	7	190117	190123	0 %	100 %	0 %	0 %	256810168
4624	NC_013156	CT	3	6	190127	190132	0 %	50 %	0 %	50 %	256810168
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4626	NC_013156	AT	4	8	190211	190218	50 %	50 %	0 %	0 %	256810168
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4993	NC_013156	ATAG	2	8	211310	211317	50 %	25 %	25 %	0 %	256810185
4994	NC_013156	TGA	2	6	211423	211428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810185
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4998	NC_013156	TAA	2	6	211513	211518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810186
4999	NC_013156	TGT	2	6	211525	211530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810186
5000	NC_013156	AGAGAT	2	12	211544	211555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810186

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